수용성 컵 방향족 탄화수소는 이온, 유기 소분자, 심지어 더 큰 생물 분자를 포함한 여러 객체 분자와 주 객체락합물을 형성할 수 있다.이락협력용은 주로 수소결합, 반데르 화력, 소수성 상호작용과 같은 비공가 상호작용에 의해 추진된다. 수용성 컵 방향족 탄화수소는 특정 객체 분자에 대한 선택성을 그 관능단을 변화시킴으로써 조절할 수 있다.이를 통해 선별적 추출, 센싱, 분리 과정을 포함한 다양한 애플리케이션에서 가치를 부여할 수 있다. 일부 수용성 컵 방향족 탄화수소는 특정 객체 분자에 대한 특정 결합 부위를 가지고 있는데, 이는 화학과 생체 인식 면에서 유익할 수 있다.
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